Guido Milanese ha studiato musica sacra a Roma, dove è stato allievo di Eugène Cardine, e lettere classiche a Genova. Insegna attualmente all'Università Cattolica di Milano e Brescia e all'Università della Svizzera Italiana; è Dottore honoris causa dell'Institut Catholique di Parigi e docente all'Istituto Superiore di Scienze Religiose della Liguria. E' studioso di canto gregoriano, materia alla quale ha dedicato un volume, numerosi saggi e interventi a congressi internazionali. Direttore della rivista "Studi Gregoriani". E' organista titolare della chiesa di San Carlo in via Balbi a Genova.